科學(xué)研究水平是衡量一個學(xué)校發(fā)展的重要指標，我校高度重視科研工作,，緊緊圍繞國家,、省市戰(zhàn)略，結(jié)合學(xué)校實際,，深入推進科研體制改革,。近年來，學(xué)?？茖W(xué)研究水平和整體科研實力都得到迅速發(fā)展。現(xiàn)有科研人員1200余人,，建有包括科技部國際科技合作基地,、教育部國別和區(qū)域研究中心、農(nóng)業(yè)部重點實驗室,、四川省重點實驗室,、四川省工程技術(shù)研究中心、四川省工程實驗室,、四川省2011協(xié)同創(chuàng)新中心等在內(nèi)的各級各類科研平臺74個,。

近五年來，承擔(dān)國家重點研發(fā)計劃及重大專項17項，國家自然科學(xué)基金89項（其中重點項目1項,、面上項目19項）,，國家社科基金29項、國家藝術(shù)基金6項,。國家自然科學(xué)基金和國家社會科學(xué)基金立項數(shù)均位居省內(nèi)高校前十,，國家藝術(shù)基金立項數(shù)位居省內(nèi)高校前三。2019年科研經(jīng)費2.48億元,，近五年師均經(jīng)費10.36萬元,。近五年，獲得省部級及以上科研獎勵61項,，其中一等獎8項,，二等獎12項，三等獎41項,， “超長壽命疲勞裂紋萌生機理與壽命預(yù)測”榮獲2018年度國家自然科學(xué)二等獎,，“阿卡波糖原料和制劑生產(chǎn)的關(guān)鍵技術(shù)及產(chǎn)業(yè)化”榮獲2014年度國家科技進步二等獎，《“三禮”名物詞研究》入選2015年度《國家哲學(xué)社會科學(xué)成果文庫》,；獲得專利授權(quán)近1200項,。

2019年發(fā)表SCI 408篇，在2020年最新公布的自然指數(shù)Nature Index榜單中,，位列在川高校第6位,，全國高校第166位，全球高校第823位,。多篇論文入選ESI高被引及熱點論文,，并先后在《自然微生物》、《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》,、《柳葉刀》,、《德國應(yīng)用化學(xué)》等國際頂級學(xué)術(shù)期刊發(fā)表署名文章，ESI總被引頻次超過11000次,。王清遠教授自2014年以來,，連續(xù)六年入選中國“高被引學(xué)者”榜單。

2015年,，學(xué)校為進一步推進科研體制創(chuàng)新改革,，成立了高等研究院，旨在集聚和穩(wěn)定一批專職科研隊伍,，從事高端科學(xué)研究,，形成 “科研特區(qū)”、“人才特區(qū)”,， 圍繞國家,、省市重大戰(zhàn)略及科學(xué)前沿問題，長期穩(wěn)定地開展基礎(chǔ)研究、應(yīng)用基礎(chǔ)研究和關(guān)鍵工程技術(shù)研究,，促進我?？萍几偁幜缭绞桨l(fā)展，最終實現(xiàn)建成與國家級中心城市地位相匹配的高水平應(yīng)用型綜合大學(xué)的建設(shè)目標,。